Reacción a "Un estudio español en Nature replantea el origen de nuestras células como una historia de alianzas microbianas"

El artículo es técnicamente riguroso y de buena calidad, en general.

El trabajo concuerda con una visión emergente del ancestro unicelular de todos los organismos complejos modernos (denominado LECA, el último ancestro común eucariota) como un microbio nadador con miles de genes y con gran parte de la complejidad de las células modernas ya presente hace entre 1.500 y 1.800 millones de años. Los autores demuestran que los genes de LECA surgieron de múltiples ancestros anteriores, una combinación de genes de diferentes ramas del árbol de la vida microbiana e incluso de virus. Este trabajo, junto con el de otros grupos, nos ofrece una visión de los primeros pasos en la evolución de los organismos complejos modernos.

[En cuanto a posibles limitaciones] Como ocurre con cualquier intento de remontarse tan atrás en el tiempo, incluso si la visión general es correcta, preveo que los detalles seguirán perfeccionándose y cambiando ligeramente con futuros análisis. En particular, a medida que la comunidad científica mundial continúa descubriendo más ramas de la vida microbiana, podemos esperar estimaciones cada vez más precisas del origen de los genes modernos.

Trabajo en la misma área general y, casualmente, mi grupo también publicó un artículo la semana pasada que informa sobre el proteoma y el interactoma de LECA. Nuestro artículo se publicó hace una semana en Cell Genomics. Describe la determinación de los genes codificadores de proteínas (el proteoma) presentes en LECA y luego aborda la cuestión de cómo estas proteínas se organizaron en ‘máquinas moleculares’, capturando la organización física de la maquinaria bioquímica básica en este ancestro crítico de toda la vida compleja moderna. Luego aplicamos esta información para estudiar los organismos actuales, incluyendo el descubrimiento de nuevos genes que afectan, por ejemplo, la densidad ósea o los defectos congénitos, basándonos en estas proteínas e interacciones ancestrales.

En contraste, el artículo del grupo de Toni Gabaldón también define primero los genes en LECA, pero luego aborda la cuestión de su origen, es decir, su ascendencia: ¿surgieron de ancestros bacterianos o arqueales? ¿Se pueden determinar estos orígenes con mayor precisión? Por lo tanto, nuestros dos artículos son bastante complementarios, ya que ambos comparten el mismo objetivo inicial (definir los genes codificadores de proteínas en LECA) y luego los utilizan para plantear preguntas diferentes. No puedo comparar directamente nuestros resultados sin tener acceso a todos los datos (y tiempo para estudiarlos), pero al menos los métodos generales para determinar los genes en LECA parecen bastante comparables (citan nuestra preimpresión de bioRxiv como un método relevante para su artículo), y ambos determinamos un número total similar de familias de genes que nuestros grupos datan de LECA, con el grupo de Gabaldón estimando entre 7.751 y 12.907 familias de genes LECA (ortogrupos) y nuestro artículo estimando entre 6.429 y 10.091 ortogrupos LECA, ambos rangos que dependen del rigor del análisis. Por lo tanto, a grandes rasgos, las primeras partes de nuestros artículos parecen ser muy concordantes.

Así pues, si bien ambos grupos describen los genes de LECA, nuestro trabajo los utiliza como punto de partida para estudiar genes y enfermedades modernas, mientras que el trabajo de Bernabeu, Manzano-Morales, Marcet-Houben y Gabaldón los utiliza para remontarse aún más en el tiempo y estudiar el origen de los genes de LECA.